الفرق الرئيسي - Exome مقابل Transcriptome

يحتوي الجين على مناطق الترميز وغير الترميز داخلها. تُعرف تسلسلات الترميز باسم exons ، وتُعرف تسلسلات الترميز غير introns. يمثل تسلسل النوكليوتيدات في إكسونات الجين الكود الجيني للجين لتوليف البروتين المحدد. وبالتالي ، تبقى الإكسونات في جزيء مرنا. تُعرف منطقة exon الكاملة للجينوم باسم exome ، وهي جزء مهم من الجينوم. يتم تحويل الشفرة الوراثية للجينات إلى الشفرة الوراثية لجزيء mRNA ، وهو أمر ضروري لإنتاج البروتين. تُعرف جزيئات mRNA بأكملها التي يتم نسخها في خلية أو مجتمع خلية في وقت ما بالنسخة. الفرق الرئيسي بين exome و transcriptome هو أن exome يمثل تسلسل مناطق exon في الجينوم بينما يمثل transcriptome إجمالي الرنا المرسال للخلية أو الأنسجة في وقت معين.

المحتويات 1. نظرة عامة والفرق الرئيسي 2. ما هو Exome 3. ما هو Transcriptome 4. مقارنة جنبًا إلى جنب - Exome و Transcriptome 5. ملخص

ما هو إكسوم؟

تتكون الجينات من الإكسونات والإنترونات والتسلسلات التنظيمية. الإكسونات هي مناطق الجينات التي يتم نسخها إلى تسلسل مرنا أثناء النسخ. تتم إزالة introns وغيرها من المناطق غير الترميز أثناء النسخ. يحدد تسلسل النوكليوتيدات في الإكسونات الكود الجيني للجين الذي يجمع البروتين المحدد الذي يرمز له. تبقى فقط exons داخل مرنا من البروتين. تُعرف مجموعة exons في الجينوم باسم exome للكائن الحي. يمثل جزءًا من الجينوم الذي يتم التعبير عنه في الجينات. في البشر ، يمثل exome 1٪ من الجينوم. وهو جزء ترميز البروتين من الجينوم البشري.

ما هو النص؟

النص هو عبارة عن مجموعة من جميع نسخ الترميز والبروتين (RNAs) في نسيج معين. يمثل Transcriptome مجموعة من جزيئات mRNA الكلية المعبر عنها من الجينات الموجودة في خلية أو نسيج. يمكن أن يتغير نص الخلية مع نسخة من نوع خلية آخر. النص هو أيضا ديناميكي - يتغير مع مرور الوقت استجابة للمنبهات الداخلية والخارجية على حد سواء. حتى داخل نفس النسيج أو داخل نفس نوع الخلية ، يمكن أن يتغير النص بعد بضع دقائق.

نسخة من يختلف عن exome للكائن الحي. يشمل النص فقط تسلسل exome المعبر عنه. على الرغم من أن exome للخلية لا يزال كما هو ، إلا أن النسخ يختلف بين الخلايا لأن التعبير الجيني ليس هو نفسه بالنسبة لجميع الخلايا أو الأنسجة. يتم التعبير عن الجينات الأساسية فقط في خلايا وأنسجة مختلفة. التعبير الجيني هو نسيج معين أو نوع معين من الخلايا. يتم تنظيمها من قبل العديد من العوامل بما في ذلك العوامل البيئية. لذلك ، يمكن أن يختلف النص مع الظروف البيئية الخارجية.

يستخدم Transcriptome كسلائف لدراسات البروتينات. وتستمد جميع البروتينات من تسلسل مرنا. يمكن أن تؤدي التعديلات الانتقالية إلى تغييرات في البروتينات. ومع ذلك ، يقدم النص الأصلي معلومات أساسية مهمة للدراسات البروتينية.

ما هو الفرق بين Exome و Transcriptome؟

ملخص - Exome مقابل Transcriptome

الإكسونات هي تسلسل الترميز للجينات وتحديد تسلسل mRNA للبروتينات. تُعرف مجموعة متواليات الترميز هذه (exons) باسم exome للكائن الحي. يتم نسخ الجينات في جزيئات مرنا قبل صنع البروتينات. تُعرف جزيئات mRNA الكلية للخلية أو الأنسجة في أي وقت من الأوقات باسم transcriptome. يمثل Transcriptome الجينات التي يتم التعبير عنها بنشاط في الرنا في أي وقت. Transcriptome هو الخلية والأنسجة محددة ويؤثر على الظروف البيئية. هذا هو الفرق بين exome و transcriptome.

المراجع: 1. سارة وآخرون ، "الالتقاط المستهدف والتسلسل المتوازي بشكل كبير لـ 12 من الإكسومات البشرية". طبيعة. مكتبة الولايات المتحدة الوطنية للطب ، 10 سبتمبر 2009. الويب. 01 أبريل 2017 2.Mutz et al. "تحليل النص باستخدام تسلسل الجيل التالي." إلسفير: مقالة مواقع. Np ، سبتمبر 2012. الويب. 01 أبريل 2017

الصورة مجاملة: 1. "نسخة من الخلايا المتعددة القدرات" بقلم جرسكوفيتش ، م. ورامالهو سانتوس ، م. The Stem Cell Research Community، StemBook، doi / 10.3824 / stembook.1.24.1، http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook الشكل 2 نسخة من خلايا متعددة القدرات. جرسكوفيتش ، م. ورامالو سانتوس ، م. The Stem Cell Research Community، StemBook، doi / 10.3824 / stembook.1.24.1، (CC BY 3.0) عبر Commons Wikimedia